Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARID3CA6NKF2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms