Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LIPT2A6NK58 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms