Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SNX13Q9Y5W8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SNX13Q9Y5W8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms