Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PHLDA3Q9Y5J5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms