Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHMP3Q9Y3E7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHMP3Q9Y3E7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms