Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A4

RRP7A, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7AQ9Y3A4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RRP7AQ9Y3A4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RRP7AQ9Y3A4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms