Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNIP3Q9Y2W7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNIP3Q9Y2W7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms