Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FARSAQ9Y285 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms