Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTF2A1LQ9UNN4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms