Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms