Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNX12Q9UMY4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms