Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
INO80Q9ULG1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
INO80Q9ULG1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms