Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms