Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP21Q9UK80 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP21Q9UK80 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms