Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LAMTOR3Q9UHA4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms