Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DBF4Q9UBU7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DBF4Q9UBU7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms