Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLKQ9UBT6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLKQ9UBT6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms