Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms