Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HCN3Q9P1Z3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HCN3Q9P1Z3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms