Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHRF1Q9P1Y6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHRF1Q9P1Y6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms