Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LRP1BQ9NZR2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1BQ9NZR2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms