Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ASF1BQ9NVP2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms