Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GINM1Q9NU53 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GINM1Q9NU53 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms