Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPMQ9NSP4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms