Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBP3Q9NS15 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
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