Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMPRSS4Q9NRS4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms