Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CHST12Q9NRB3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHST12Q9NRB3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms