Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FANCFQ9NPI8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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