Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELL3Q9HB65 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELL3Q9HB65 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms