Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NRDE2Q9H7Z3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NRDE2Q9H7Z3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms