Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C11orf49Q9H6J7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms