Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDHR2Q9BYE9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms