Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PCGF6Q9BYE7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCGF6Q9BYE7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms