Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CACNG6Q9BXT2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CACNG6Q9BXT2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms