Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IFT27Q9BW83 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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