Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GINS3Q9BRX5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms