Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCL13Q99616 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms