Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAT1Q99536 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAT1Q99536 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms