Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5RAP2Q96SN8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms