Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEPDC7Q96QD5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DEPDC7Q96QD5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms