Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
LMTK3Q96Q04 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LMTK3Q96Q04 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms