Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRERF1Q96PN7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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