Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRIM47Q96LD4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM47Q96LD4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms