Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms