Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MALSU1Q96EH3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms