Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG2BQ96BY7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG2BQ96BY7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms