Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UPRTQ96BW1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UPRTQ96BW1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms