Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SH3KBP1Q96B97 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms