Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms