Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPTSSAQ969W0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPTSSAQ969W0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms